Fork me – Dados Genéticos no Github

Ontem Manu Sporny criou um repositório com os seus dados genéticos no Github, permitindo a análise e tratamento dos mesmos por qualquer indivíduo, instituição ou empresa. Os dados estão disponíveis sob uma licença CCO – Creative Commons Public Domain License.

Convém esclarecer desde já que não se trata do genoma completo, mas sim dos dados genéticos que se podem obter a partir do serviço 23andme. O genoma humano possui cerca de 10 milhões de marcadores genéticos, sendo disponibilizados por este serviço a “somente” identificação de perto de 1 milhão e a análise de 160. Esta análise estatística elabora sobre a probabilidade de desenvolver no futuro determinada patologia com fundamento no código genético. Esta iniciativa levanta mais uma vez questões relativas à privacidade, protecção de dados e à acessibilidade ao que somos na essência. Esses temas e como o “autor” do código genético os equaciona são discutidos no seu blog, em particular nos comentários que surgiram de imediato. Sobre isso não farei comentários pois sai do objectivo deste artigo.

Não se pense contudo que esta atitude é inédita, pois já existem vários projectos similares que vieram à luz recentemente. Por exemplo o genomes unzipped, o Personal Genome Project, o Harappa Ancestry Project, e o Download my Genome de Sam Snyder. Os objectivos destes projectos variam na forma, mas orbitam a criação de ferramentas de análise e visualização da sequência genética. Deste modo procura-se acelerar o desenvolvimento de soluções de auxílio à investigação de doenças de origem genética. Uma base de conhecimento sobre a análise do código genético é a SMPedia, uma wiki onde se regista o significado de cada marcador genético e onde se alojam algumas ferramentas de análise do mesmo. Neste caso concreto o autor pretende gerar uma dinâmica de comunidade em torno de projecto de software livre que resulte em ferramentas web para melhorar os outputs actualmente disponíveis para tratar este tipo de dados. Em paralelo está a desenvolver uma startup em torno de uma aplicação com este mesmo objectivo. Outro projecto que já tem código utilizável é o que Nikhil Gopal apresenta. Tratam-se de ferramentas em Python para analisar os dados disponibilizados pela 23andMe. Também estão acessíveis num repositório Github.

Mas, não fosse o Github uma plataforma comunitária onde não há limites à imaginação, entre os vários forks que já se fizeram do código genético de Manu Sporny (14 no primeiro dia!), já existem patches que resolvem “bugs” e melhoram as capacidades do ser “original”. É o caso do TeMPOraL ou do cariaso, que resolveram um problema com o fechar da pálpebras e removeram o risco de doenças coronárias.

Sem deixar de ter o seu humor, é uma perspectiva verdadeiramente assustadora, este tunning do ser humano. Daqui a quanto tempo não se passará dos testes em software com a diminuição das “issue cues” aos protótipos de carne e osso?

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